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我校多倍体基因定位研究方面两篇论文引关注

 

    多倍体因其复杂的遗传规律,在基因定位方面一直很难突破。近年来,我校计算生物学中心研究人员攻克了多项有关多倍体基因定位难题。近日,又有重要成果以两篇论文的形式发表在国际生物信息顶尖学术期刊《Briefings in Bioinformatics》(IF: 5.298)上面,在国际上引起广泛关注。

 

    第一篇论文根据同源多倍体的起源特性,首次把双减数分裂原理引入基因定位框架,不仅能显著提高遗传作图的统计功效,还能对同源多倍体双减数分裂机理做出合理的生物学解释。

 

    “这项工作是针对同源多倍体双减数分裂所发展出来的统计模型,应该是多倍体基因定位的里程碑。”美国农业部植物遗传学家Bill Anderson博士说,“我们正着手使用这一方法来制定包括柳枝稷在内的多种多倍体能源作物的遗传图谱,期望获得重要的研究结果。”

 

    第二篇论文针对在重要学术期刊BMC Biology上发表的关于四倍体进化研究存在的模型选择问题,提出新型连锁分析方法,对原始数据重新进行分析,对四倍体进化获得了更为科学的生物学解释。

 

    “在原文中,作者使用简单的二倍体连锁模型分析四倍体数据,所获得的结论有失偏颇,针对这一问题,我们分别发展出同源四倍体、异源四倍体模型来重新分析数据,更正了有关结论。”两篇论文的责任作者、计算生物学中心主任邬荣领教授说。

 

    “目前多倍体基因定位模型工作远远落后于其他物种,因此开展这方面工作是十分迫切的。”邬荣领教授说,“我校计算生物学中心希望在多倍体基因组研究领域做出一批国际领先的成果。目前发表的这两篇论文仅仅是初步的,后面将有更系统、更深入的工作出现。”

 

    多倍体是含有三个或三个以上染色体组的一类生物,在生物界广泛存在,具有极其重要的研究价值和经济价值。农作物中的小麦、马铃薯、棉花和花卉中的菊花、玫瑰等重要物种都是多倍体。在林木中,多倍体现象也越来越被认为比原先发现的更为普遍,这些都显示多倍体基因定位模型开发的潜在价值。

 

    这两篇论文的第一作者均为计算生物学中心博士研究生徐放,毕业于我校计算生物学中心、现在美国宾夕法尼亚州立大学攻读博士学位的吕亚非等也做出了重要贡献。

 

    据悉,邬荣领教授所领导的团队正在与山东林果所合作,利用发展的模型研究六倍体柿子抗病形状的遗传变异。

 

论文链接:

1. http://bib.oxfordjournals.org/content/early/2013/10/30/bib.bbt073.abstract

 

2. http://bib.oxfordjournals.org/content/early/2013/10/30/bib.bbt075.abstract

 

 

 

 

作者:梁丹
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